En ny aktør træder frem i skurkenes underverden i form af Meta Liberation Army. Ledet af direktøren for Detnerat Corporation forbereder MLA en ny metahuman revolution. I deres øjne er League of Villains en hindring, der skal fjernes, men Tomura og hans bande har ikke tænkt sig at gå stille med dørene. Det er hær mod liga i en altomfattende krig, og magtbalancen skal afgøres.