Deres landsby er under angreb, men Naruto, Sakura og Shikamaru kan ikke blive tilbage for at forsvare den.

De har fået en mission med højeste prioritet. De skal finde Sasuke og Sand-genin.

Men med ni blodtørstige ninjaer i hælene er jægerne hurtigt blevet til de jagede.

Tilbage i landsbyen er den tredje Hokage stadig fanget i Orochimarus uigennemtrængelige barriere. Presset til det yderste må Hokagen beslutte, hvor langt han vil gå for at beskytte det, der betyder mest for ham.