Naruto kæmper nu mere end nogensinde i samklang med de halede bæster og deres jinchûriki-værter. Hans nye styrke imponerer de Allierede Shinobi-styrker.

Men hans venner vil ikke lade den afgørende kamp mod Tobi hvile på Narutos skuldre alene. Mens de skynder sig til hans hjælp, vender Sasuke tilbage. Og denne gang er han fast besluttet på at besejre Naruto én gang for alle.